/etc/nginx/sites-available/defaultの中身を下記の内容で書き換える:

server {
    listen      80 default_server;
    server_name _;
    return      444;
}

で、nginxを再起動して完了:

sudo service nginx restart

参考:https://serverfault.com/questions/420351/best-way-to-prevent-default-server